Predsjedništvo Skupštine Saveza (Predsjedništvo) je izvršni organ Skupštine, koji usklađuje rad svih organa i radnih tijela Saveza. Članovi Predsjedništva biraju se na Skupštini na period od četiri godine i čine ga općinski načelnici, odnosno gradonačelnici. Predsjedništvo se sastoji od 13 članova - predsjednik, zamjenik predsjednika i jedanaest članova koji se biraju na slijedeći način:

• općine/gradovi sa područja svog kantona između sebe biraju po jednog predstavnika,
• Grad Sarajevo ima jednog predstavnika.

Izabrani član Predsjedništva sa područja kantona dužan je da predstavi usaglašene stavove načelnika općina i gradova koje predstavlja. Predsjednik i zamjenik predsjednika se rotiraju svake dvije godine i ne mogu biti iz reda istog konstitutivnog naroda. Nadležnosti Predsjedništva regulisane su u članu 27. Statuta Saveza. Od svih organa Saveza, Predsjedništvo se sastaje najčešće i odlučuje o svim važnim pitanjima za rad Saveza, izjašnjava se o pristiglim inicijativama, daje saglasnost za određene aktivnosti, donosi odluke i zaključke, usvaja dokumente, inicira aktivnosti i općenito strateški usmjerava rad Saveza. Članovi Predsjedništva rade isključivo na volonterskoj osnovi.

Predsjedništvo može raditi i odlučivati ako sjednici prisustvuje većina članova, a odlučuje većinom glasova izabranih članova Predsjedništva.

Na IX sjednici Skupštine Saveza općina i gradova FBiH održanoj u Čapljini 5.05.2017. godine izabrani su predsjednik, zamjenik predsjednika i članovi Predsjedništva.

Predsjednik Predsjedništva:

1. Hamdo Ejubović, načelnik Općine Hadžići

Zamjenik predsjednika Predsjedništva:

1. Ivan Vukadin, načelnik Općine Tomislavgrad

Članovi:

1. Nedžad Ajnadžić, načelnik Općine Centar Sarajevo
2. Nermin Ogrešević, gradonačelnik Grada Cazina
3. Stanko Vincetić, načelnik Općine Orašje
4. Tajib Muminović, načelnik Općine Teočak
   
5. Muhamed Ramović, gradonačelnik Grada Goražda
6. Branko Bago, načelnik Općine Posušje
7. Nermin Mandra, načelnik Općine Kakanj
8. Edin Hozan, načelnik Općine Jajce
9. Marin Radišić, načelnik Općine Čitluk
10. Abdulah Skaka, gradonačelnik Grada Sarajeva
11. Luka Čelan, gradonačelnik Grada Livna.

Mandat članova Predsjedništva traje do izbora novih, nakon održanih lokalnih izbora 2020. godine.

Članovi Predsjedništva u mandatu 2013. - 2017.

Na VII sjednici Skupštine Saveza općina i gradova FBiH održanoj u Fojnici 6. i 7.02.2013. godine izabrani su predsjednik, zamjenik predsjednika i članovi Predsjedništva.

Predsjednik Predsjedništva:

1. Ivo Jerkić Ino, načelnik Općine Čitluk

Zamjenik predsjednika Predsjedništva:

1. Husejin Smajlović, gradonačelnik Grada Zenice (23.02.2015. - 21.05.2016.)
   

Članovi:

1. Nedžad Koldžo, načelnik Općine Novo Sarajevo
2. Agan Bunić, načelnik Općine Bužim
3. Mario Jurkić, načelnik Općine Domaljevac - Šamac (izabran nakon održanih prijevremenih lokalnih izbora, 18.12.2014. godine, organiziranih nakon što je dotadašnji načelnik Željko Josić, izabran za poslanika u Skupštini Posavskog kantona na Općim izborima održanim 12.10.2014. godine)
4. Nedžad Džafić, načelnik Općine Kalesija (izabran nakon održanih prijevremenih lokalnih izbora, 22.02.2015. godine, organiziranih nakon što je dotadašnji načelnik Rasim Omerović, izabran za poslanika u Predstavničkom domu Parlamenta FBiH na Općim izborima održanim 12.10.2014. godine)
   
5. Muhamed Ramović, načelnik Općine Goražde
6. Ljubo Grizelj, načelnik Općine Grude
7. Amra Babić, načelnica Općine Visoko
8. Asim Mekić, načelnik Općine Busovača
9. Emir Bubalo, načelnik Općine Konjic
10. Edin Smajić, načelnik Općine Vogošća
11. Ivan Vukadin, načelnik Općine Tomislavgrad.

Mandat članova Predsjedništva traje do izbora novih, nakon održanih lokalnih izbora 2016. godine.